Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms