Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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