Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC4A6NH21 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms