Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPDC1A2A3K4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms