Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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