Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF346Q9UL40 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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