Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms