Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms