Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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H2AFJQ9BTM1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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