Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSEN34Q9BSV6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms