Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms