Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms