Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms