Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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COPS9Q8WXC6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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COPS9Q8WXC6 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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