Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms