Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBRM1Q86U86 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBRM1Q86U86 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBRM1Q86U86 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PBRM1Q86U86 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBRM1Q86U86 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms