Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms