Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms