Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms