Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KLHL22Q53GT1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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