Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms