Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms