Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms