Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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