Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms