Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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