Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms