Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms