Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms