Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSCP56915 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSCP56915 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms