Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD23BP54727 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms