Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms