Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms