Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms