Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms