Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PEX2P28328 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PEX2P28328 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PEX2P28328 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PEX2P28328 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.2 ms