Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms