Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ITGA3P26006 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms