Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms