Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms