Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms