Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB3P14651 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 497.8 ms