Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms