Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF1P10914 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms