Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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