Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSF2P04141 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSF2P04141 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSF2P04141 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSF2P04141 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms