Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SIX3O95343 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX3O95343 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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