Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRPO00591 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABRPO00591 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms