Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.4 ms