Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms